フリック入力で二重パッチムの打ち方がわかりません。

左パッチム→右パッチムの順に打つだけです。

たとえば「않」なら「ㅇ→ㅣ→・→ㄴ→ㅎ」の順に打ちます。

その間にエンターキーなどを押してしまうと次のマスに移動してしまうので、そのまま続けて打ちましょう。

また、「ㄱㅎ」や「ㅎㄱ」という存在しない二重パッチムを打とうとすると、「악ㅎ」や「앟ㄱ」とどうやっても打てないです（存在しない二重パッチムなので）。

なので、二重パッチムを打てないときは
・打つ順番が違う
・途中でエンターキーなど押してしまった
・存在しない二重パッチムを打った

以上の原因が考えがえられると思います。